阴茎上长了3个小颗粒，可能是以下原因引起：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状。
2.珍珠状阴茎丘疹：常见于20-30岁左右的男性，病因尚未明确，可能与包皮过长、局部刺激等有关。表现为阴茎冠状边缘和冠状沟出现的珍珠状、半透明丘疹，丘疹无压痛、无破溃，一般无自觉症状。
3.皮脂腺异位症：病因不明，可能与青春期内分泌变化、局部刺激等因素有关。好发于口腔黏膜、阴茎龟头、包皮内板等部位，表现为针头大小、孤立的、黄白色小丘疹，无自觉症状。
4.阴茎肿瘤：如阴茎癌，可表现为阴茎上出现丘疹、结节、溃疡等，伴有恶臭、出血、疼痛等症状。
此外，还有其他原因可能导致阴茎上长小颗粒，如传染性软疣、假性湿疣等。
鉴于引起阴茎上长小颗粒的原因较多，且可能会影响到男性的生殖健康和心理健康，建议及时就医，进行相关检查，如醋酸白试验、HPV检测、病理检查等，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
在就医前，应注意保持局部清洁，避免搔抓、摩擦，避免使用刺激性的清洁剂或药物。同时，应避免性生活，以免传染给他人。
对于有过不洁性行为的人，应及时告知医生，以便进行针对性的检查和治疗。此外，如果小颗粒伴有疼痛、瘙痒、出血、恶臭等症状，或短期内迅速增大，应立即就医。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体情况可能因个体差异而有所不同。如果对阴茎上的小颗粒有任何疑虑或担忧，应及时咨询专业医生，以获得准确的诊断和治疗建议。