胃肠道反应
常见的是胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹泻等，这是因为秋水仙碱对胃肠道黏膜有刺激作用，可能影响胃肠道的正常消化和吸收功能，尤其在用药初期较易出现。
骨髓抑制
可能抑制骨髓造血功能，导致白细胞、血小板等血细胞计数减少，使机体抵抗力下降，容易发生感染等情况，还可能引起出血倾向等问题，这与秋水仙碱对骨髓细胞的毒性作用有关。
肝肾功能损害
长期或大剂量使用可能对肝肾功能造成损害，影响肝脏的代谢功能和肾脏的排泄功能，可通过检测肝功能中的转氨酶等指标以及肾功能中的肌酐等指标来监测，老年人或本身有肝肾功能基础疾病的人群更易受影响。
神经毒性
部分患者可能出现神经毒性反应，表现为手脚麻木、刺痛、无力等，这是由于秋水仙碱影响神经细胞的正常功能，神经系统敏感的人群相对更易出现此类副作用。