输精管堵塞的原因主要有以下几点：
1.先天性畸形：如附睾头、体、尾段缺失，输精管一段或完全缺失，输精管与附睾不连接，附睾、输精管或精囊发育不全等。
2.炎症：附睾炎、前列腺炎、精囊炎或附睾输精管结核等，造成输精管道梗阻，以附睾与输精管连接部较多见。
3.肿瘤：来自输精管道本身或邻近器官肿瘤压迫所致管腔不通，也是造成无精症的原因之一。
4.损伤：如疝修补术、精索静脉曲张、精索肿瘤手术等，可伤及输精管；附睾精液囊肿、睾丸鞘膜积液手术，可伤及附睾；前列腺手术可引起射精管口闭塞；或虽无直接损伤，但术后感染粘连，疤痕形成等均可使输精管道受压、梗阻。
5.附睾处囊肿：附睾处囊肿压迫亦会造成输精管道阻塞。