肛门疼痛可能由多种原因引起，用药需要根据具体病因来选择，以下是一些常见情况及相应的药物：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开后形成的感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。可以使用止痛栓剂，如利多卡因凝胶栓剂，能起到局部止痛作用；还可使用高锰酸钾温水坐浴，保持局部清洁，促进裂口愈合。
2.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，也会引起肛门疼痛。可口服地奥司明片，减轻局部水肿；外用痔疮膏、栓剂，如马应龙痔疮膏、肛泰栓等，有清热解毒、消肿止痛的作用。
3.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，表现为肛门疼痛、肿胀。需要使用抗生素，如头孢呋辛酯片，控制感染；脓肿形成后，需行手术切开引流。
4.肛管直肠损伤：肛门部外伤、肛裂或内痔注射等治疗后，可因肛管或直肠损伤、感染而引起疼痛。可口服抗生素，如头孢克洛胶囊，预防感染；同时使用止痛药物，如布洛芬缓释胶囊。
5.肛门皮肤病：如肛门湿疹、神经性皮炎、股癣等，也可引起肛门瘙痒、疼痛。可外用糖皮质激素软膏，如丁酸氢化可的松乳膏，缓解症状；或使用抗真菌药物，如硝酸咪康唑乳膏，治疗真菌感染。
需要注意的是，以上药物均应在医生的指导下使用，切勿自行用药。此外，肛门疼痛还可能由其他原因引起，如肛管直肠癌等，因此，如果肛门疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。