尿道两侧有疙瘩可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可导致尿道两侧出现红肿、疙瘩等症状。此外，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等尿道刺激症状。尿道炎可由细菌、病毒、支原体等感染引起。治疗尿道炎通常采用抗生素药物，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，保持尿道口清洁、多饮水、多排尿有助于康复。
2.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病，主要通过性接触传播。病变主要表现为外生殖器及肛门周围的疣状赘生物，可逐渐增大、增多。如果尿道两侧的疙瘩呈疣状，且有不洁性生活史，应高度怀疑尖锐湿疣。治疗尖锐湿疣主要采用物理治疗，如激光、冷冻、电灼等，也可使用外用药物，如咪喹莫特乳膏等。此外，免疫调节剂如干扰素也可用于辅助治疗。
3.尿道肉阜：尿道肉阜是女性尿道末端的良性息肉样组织，多见于绝经后女性。尿道肉阜通常表现为尿道口的红色或紫红色肿物，有时可伴有出血、疼痛等症状。较小的尿道肉阜一般无需治疗，较大的肉阜可通过手术切除。
4.其他：尿道两侧的疙瘩还可能与尿道口囊肿、尿道憩室、肿瘤等疾病有关。
总之，尿道两侧有疙瘩可能是多种疾病的表现，如果伴有其他症状或持续不愈，应及时就医，进行相关检查，如尿道分泌物涂片、培养，HPV检测，尿道镜检查等，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，注意个人卫生，避免不洁性生活，有助于预防尿道疾病的发生。