高危型HPV阳性大多没有明显症状，部分人可能会出现生殖器部位的异常表现。比如，女性可能会在宫颈部位发生病变，但早期往往没有特殊感觉。据统计，大多数人感染高危型HPV后，免疫系统可在数月到2年左右清除病毒，自身无明显不适症状。
生殖器部位表现
外阴异常： 部分高危型HPV感染可能会在外阴部位出现丘疹、小疙瘩等情况，这些丘疹大小不等，形状多样，有的像菜花状、乳头状等。宫颈变化： 女性感染高危型HPV后，宫颈可能会有一些细微的变化，但早期一般不会有疼痛等明显感觉。通过宫颈涂片等检查可以发现宫颈细胞的异常改变。
与其他疾病的关联表现
与尖锐湿疣关联： 高危型HPV中的某些亚型持续感染可能会引发尖锐湿疣，在生殖器部位出现典型的赘生物，这些赘生物初期可能较小，逐渐增大增多，形状不一。与宫颈病变关联： 长期高危型HPV感染可能会导致宫颈上皮内瘤变等宫颈病变，不过在病变初期大多没有特殊的自觉症状，往往是通过定期的宫颈癌筛查才被发现。
身体其他系统表现
呼吸道表现： 极少数情况下，高危型HPV感染可能会累及呼吸道，引起呼吸道的乳头状瘤等，但这种情况非常罕见，主要表现为呼吸道梗阻等相关症状，不过这种情况在高危型HPV阳性中所占比例极低。消化道表现： 高危型HPV感染累及消化道也极为少见，可能会出现消化道部位的异常增生等情况，但一般很难通过常规表现发现，多在相关检查时被察觉。