蛋白尿的治疗药物需根据病因来选择。一般来说，如果是肾病综合征导致的蛋白尿，常用药物有糖皮质激素，如泼尼松，初始治疗时可能需要足量使用8~12周，之后逐渐减量。
原发性肾小球疾病导致蛋白尿的用药
肾小球肾炎引起的蛋白尿：对于轻度蛋白尿的肾小球肾炎患者，可能会使用血管紧张素转化酶抑制剂（ACEI）或血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂（ARB），如贝那普利等，这类药物除了能降低蛋白尿，还能降低血压，延缓肾功能恶化。膜性肾病导致的蛋白尿：常用药物有糖皮质激素联合烷化剂，如泼尼松联合环磷酰胺，不过环磷酰胺使用时要注意其可能导致的骨髓抑制等不良反应。
继发性肾小球疾病导致蛋白尿的用药
糖尿病肾病引起的蛋白尿：首先要严格控制血糖，同时也可使用ACEI或ARB类药物来减少蛋白尿，如氯沙坦等，这类药物能改善糖尿病肾病患者的蛋白尿情况，延缓肾病进展。狼疮性肾炎导致的蛋白尿：治疗常用糖皮质激素联合免疫抑制剂，如泼尼松联合吗替麦考酚酯，糖皮质激素可以快速抗炎，免疫抑制剂能抑制异常的免疫反应，从而减少蛋白尿。
其他原因导致蛋白尿的用药
高血压肾损害引起的蛋白尿：主要是积极控制血压，首选ACEI或ARB类药物，将血压控制在130/80mmHg以下，以减少蛋白尿，保护肾功能。高尿酸血症肾损害导致的蛋白尿：在控制血尿酸水平的同时，也可使用保护肾脏、减少蛋白尿的药物，如ACEI或ARB类药物，同时要低嘌呤饮食，多喝水促进尿酸排泄。需要注意的是，蛋白尿的用药必须在医生的指导下进行，医生会根据患者的具体病情、肾功能、蛋白尿程度等多方面因素来选择合适的药物，并且在用药过程中要密切监测患者的肝肾功能、尿常规等指标，根据情况调整治疗方案。不同药物有不同的适应证和禁忌证，例如孕妇、哺乳期妇女、肝肾功能不全者等使用药物时要特别谨慎。