大脑发育迟缓可能由多种原因引起。据相关医学研究，大约有20% - 30%的大脑发育迟缓与遗传因素有关。
遗传因素导致
基因缺陷：某些基因突变会影响大脑正常的发育进程，比如常见的一些单基因遗传病，会使得大脑在细胞增殖、分化等关键环节出现异常，从而引发发育迟缓。染色体异常：像唐氏综合征，就是由于21号染色体多了一条，这会严重干扰大脑的正常发育，导致智力、身体发育等多方面出现迟缓现象。
孕期及分娩相关因素
孕期感染：孕妇在孕期如果感染了风疹病毒、巨细胞病毒等，这些病毒有可能通过胎盘影响胎儿大脑发育，使得胎儿大脑发育迟缓。例如，孕妇在孕早期感染风疹病毒，胎儿出现大脑发育迟缓的风险会明显增加。分娩过程异常：早产、难产等分娩过程中的异常情况，可能会造成胎儿脑部缺氧缺血，进而影响大脑发育。早产儿由于各器官发育不成熟，包括大脑，更容易出现发育迟缓的问题，尤其是胎龄越小，发生大脑发育迟缓的几率越高。
出生后的环境与疾病因素
营养缺乏：婴儿出生后如果长期营养不良，特别是缺乏蛋白质、维生素B12、叶酸等营养物质，会影响大脑的正常发育。比如婴儿长期奶粉喂养且辅食添加不及时，缺乏足够的营养供给，大脑发育就可能受到阻碍。脑部疾病：出生后患上脑炎、脑膜炎等脑部疾病，炎症会损伤大脑组织，影响大脑的正常发育功能，导致发育迟缓。例如患细菌性脑膜炎后，没有得到及时有效的治疗，就可能遗留大脑发育迟缓的问题。