小儿咳嗽的治疗药物有多种，比如常用的小儿止咳糖浆，一般能缓解小儿咳嗽症状，但具体效果因个体而异。
止咳化痰类药物
小儿止咳糖浆： 主要成分有甘草流浸膏、桔梗流浸膏等，能起到止咳祛痰的作用，可用于小儿感冒引起的咳嗽。不过2岁以下儿童需在医生指导下使用。氨溴特罗口服溶液： 适用于急、慢性呼吸道疾病（如急、慢性支气管炎、支气管哮喘、肺气肿等）引起的咳嗽、痰液黏稠、排痰困难、喘息等。但6个月以下婴儿慎用。
针对病因的药物
抗感染药物： 如果小儿咳嗽是由细菌感染引起，可能会用到抗生素，如头孢克肟颗粒等。但头孢克肟颗粒禁用于对头孢菌素类抗生素过敏的患儿。如果是病毒感染引起，一般可自愈，必要时可能会使用抗病毒药物，如小儿豉翘清热颗粒等，但使用时需注意其适用年龄等情况。
外用药物
小儿止咳贴： 一般是贴在患儿胸部或背部相应穴位来缓解咳嗽。不同品牌的止咳贴成分和适用情况略有不同，比如有的止咳贴主要由中药成分组成，使用时要注意观察患儿皮肤是否有过敏反应，若贴敷部位出现瘙痒、红肿等不适，应立即取下。