无痛胃镜一般先进行术前准备，包括禁食禁水一定时间，然后患者被送入检查室，静脉注射麻醉药物，待患者进入镇静状态后插入胃镜进行检查，检查结束后患者逐渐苏醒。
术前准备环节
患者需在检查前6 - 8小时禁食、4小时禁水，以保证胃内空虚，便于胃镜观察。同时要告知医生自身病史、药物过敏史等情况。
麻醉给药阶段
患者进入检查室后，医护人员会通过静脉为患者注射麻醉药物，如丙泊酚等，使患者迅速进入镇静、睡眠状态，减轻检查时的不适。
胃镜插入检查
麻醉起效后，医生将胃镜经口腔缓缓插入，依次观察食管、胃、十二指肠的黏膜情况，过程中可能会少量充气以便更好观察。
检查后恢复
检查结束后，患者会被送往恢复室观察，待完全苏醒且无明显不适后可离开，少数患者可能会有短暂的咽部不适，一般会逐渐缓解。
对于特殊人群，如老年人，要格外关注其心肺功能情况，检查前需评估是否能耐受麻醉；孕妇一般不建议做无痛胃镜，除非病情必需；有严重心肺疾病、精神异常等情况的患者需医生进一步评估能否进行无痛胃镜检查。