月经第三天同房一般不会怀孕，但可能会对女性健康造成一些影响，具体如下：
1.怀孕：怀孕的概率较低，但不能完全排除。月经第三天通常处于安全期，此时女性一般不排卵，受孕的可能性较小。然而，女性的排卵时间可能会受到情绪、压力、环境等因素的影响而提前或推迟，所以安全期避孕并不十分可靠。如果没有怀孕计划，建议采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。
2.感染：月经期间，女性的子宫内膜脱落，子宫颈口张开，此时同房容易将细菌带入子宫，引起感染。常见的感染包括子宫内膜炎、盆腔炎等，可能导致腹痛、发热、白带异常等症状。为了减少感染的风险，建议在月经期间避免同房，并保持外阴清洁。
3.月经失调：月经期间同房可能会干扰正常的月经周期，导致月经失调。少数女性可能会出现月经量增多、经期延长或月经间期出血等情况。如果出现月经异常，建议及时就医，进行相关检查和治疗。
4.心理影响：对于一些女性来说，月经期间可能会有情绪上的变化和不适感，同房可能会加重这些情绪问题。此外，第一次同房可能会带来心理上的紧张和焦虑。
需要注意的是，每个人的身体状况和生理反应都可能不同，以上只是一些常见的情况。如果对月经期间的性行为有任何疑虑或担忧，建议咨询医生或专业的妇产科医生，以获取个性化的建议和指导。此外，尊重女性的意愿和感受，确保双方的沟通和同意也是非常重要的。保护女性的健康和权益是建立健康性关系的基础。