低烧不退且头疼，可能是以下原因引起：
1.感染性疾病：如细菌、病毒、真菌等感染引起的炎症反应，可导致低烧和头疼。
2.免疫性疾病：如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等，可出现低烧、关节痛、头痛等症状。
3.恶性肿瘤：某些恶性肿瘤可导致低烧不退，同时伴有头疼、乏力、体重下降等症状。
4.中枢神经系统感染：如脑炎、脑膜炎等，可引起发热、头疼、呕吐等症状。
5.其他：如药物热、自主神经功能紊乱等也可导致低烧不退且头疼。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况还需要结合患者的病史、症状、体征以及相关检查来综合判断。如果出现低烧不退且头疼的症状，建议及时就医，以便明确病因，进行针对性治疗。同时，在就医前应注意休息，避免劳累和剧烈运动，多喝水，以促进病情恢复。