羊水穿刺的最佳时间是16至22周。在这个阶段，胎儿较小，羊水相对较多，胎儿漂在羊水中，周围有较宽的羊水带，用针穿刺抽取羊水时，不易刺伤胎儿，抽取20毫升羊水，只占羊水总量的1/20至1/12，不会引起子宫腔骤然变小而流产，而且这个时期羊水中的活力细胞比例最大，细胞培养成活率高，可供制片、染色，作胎儿染色体核型分析、染色体遗传病诊断和性别判定，也可用羊水细胞DNA做出基因病诊断、代谢病诊断。测定羊水中甲胎蛋白，还可诊断胎儿开放性神经管畸形等。
需要注意的是，羊水穿刺有一定的风险，可能会导致感染、出血、流产等并发症。因此，在进行羊水穿刺前，医生会详细询问孕妇的病史和身体状况，并进行一系列的检查，以确保孕妇和胎儿的安全。如果孕妇有任何不适或疑虑，应及时与医生沟通。此外，羊水穿刺也不是所有孕妇都需要进行的检查，医生会根据孕妇的具体情况和需求来决定是否进行羊水穿刺。