1.与降压药联用需注意
藿香正气丸中含有乙醇（酒精）成分，部分降压药如复方利血平片、复方降压片等与含乙醇的药物联用，可能会发生双硫仑样反应，表现为头痛、头晕、恶心、呕吐、心悸等不适症状。因为乙醇会影响降压药的代谢，干扰体内乙醛的正常代谢过程，导致乙醛蓄积中毒。对于有高血压病史的患者，在服用藿香正气丸时如果同时服用降压药，需密切监测血压及自身身体状况，若出现不适要及时就医。
2.与降糖药联用的情况
一些含有格列本脲等成分的降糖药，与藿香正气丸同用可能会产生相互作用。藿香正气丸中的某些成分可能影响降糖药的作用机制，导致血糖波动。比如可能增强降糖作用，引发低血糖反应，对于糖尿病患者，尤其是老年糖尿病患者，本身血糖调节能力相对较弱，联用后更易出现头晕、出冷汗、心慌等低血糖表现，所以在联用前应咨询医生，调整用药方案并密切监测血糖。
3.与镇静催眠药联用要谨慎
像地西泮（安定）等镇静催眠药，与藿香正气丸同服时，乙醇可能会加强这类药物的中枢抑制作用，导致患者过度镇静、嗜睡，甚至影响呼吸中枢功能。对于有睡眠障碍需要服用镇静催眠药的人群，联用风险更高，会严重影响日常生活和身体机能，使用时需格外小心，最好在医生指导下进行。
4.与抗血小板药联用需留意
部分抗血小板药，如阿司匹林等，与藿香正气丸同用可能增加出血风险。因为乙醇可能会干扰血小板的功能，再加上药物之间的相互作用，会影响凝血机制，对于本身有出血倾向或者正在服用抗血小板药预防心脑血管疾病的人群，联用后发生出血事件的可能性增大，所以联用前应评估风险，由医生判断是否可以联用及采取相应的防范措施。
5.特殊人群的特别注意
老年人：老年人各器官功能衰退，药物代谢和排泄能力下降，联用上述药物时发生不良反应的风险更高。所以老年人在服用藿香正气丸时，要更加仔细地排查正在服用的其他药物，严格遵循医生的用药指导，定期进行相关指标的监测。
儿童：儿童处于生长发育阶段，肝肾功能尚未完全成熟，对药物的代谢和耐受能力较差，一般不建议儿童使用含乙醇的藿香正气丸剂型。如果有用药需求，应选择不含乙醇的剂型，并在成人监护下严格按照儿童用药的剂量等要求使用，同时密切观察用药后的反应。
肝肾功能不全者：肝肾功能不全的患者本身药物代谢和解毒能力受限，联用上述药物时，药物相互作用对肝肾功能的影响会被放大，可能进一步加重肝肾功能损害。这类患者在使用藿香正气丸前，务必告知医生自己的肝肾功能状况，由医生综合评估后决定是否用药及调整用药方案。