耳朵深处一抽一抽的疼，可能与以下原因有关。
1.外耳道炎
外耳道皮肤外伤或局部抵抗力降低时，易发生外耳道炎。中耳炎脓液、游泳时进水、挖耳损伤外耳道等，可引发外耳道炎。此外，全身性疾病，如糖尿病、贫血、内分泌功能紊乱、维生素缺乏等，也可导致外耳道炎的发生。外耳道炎可导致外耳道皮肤肿胀、疼痛，牵拉耳廓或按压耳屏时疼痛加剧，同时还可能伴有耳部瘙痒、耳闷、听力下降等症状。
2.中耳炎
中耳炎是累及中耳（包括咽鼓管、鼓室、鼓窦及乳突气房）全部或部分结构的炎性病变，好发于儿童。可分为非化脓性及化脓性两大类。非化脓性者包括分泌性中耳炎、气压损伤性中耳炎等，化脓性者有急性和慢性之分。常见症状为耳部疼痛、听力下降、耳鸣、耳闷等。如果中耳腔内存在炎症，可能会刺激耳部末梢神经，引起耳朵深处一抽一抽的疼。
3.耵聍栓塞
耵聍栓塞是指外耳道内耵聍分泌过多或排出受阻，使耵聍在外耳道内聚集成团，阻塞外耳道。耵聍栓塞可导致听力下降、耳鸣、耳痛等症状，有时也会引起耳朵深处一抽一抽的疼。
4.耳部神经痛
耳部神经痛是一种原因不明的耳部神经病理性疼痛，可由多种原因引起，如病毒感染、神经损伤、自身免疫性疾病等。耳部神经痛的特点是耳部闪电样、刀割样、针刺样、烧灼样疼痛，发作频繁，可持续数秒至数分钟，间歇期无症状。
5.其他
耳朵深处一抽一抽的疼还可能与外耳道疖肿、颞下颌关节紊乱综合征、耳部肿瘤等原因有关。
如果出现耳朵深处一抽一抽的疼，建议及时就医，明确原因后进行针对性治疗。同时，在就医前应避免自行挖耳，以免加重病情。