他克莫司是一种免疫抑制剂，在使用过程中可能会出现一些副作用。一般来说，使用他克莫司后，约有30% - 60%的患者会出现不同程度的副作用。
神经系统方面的副作用
头痛： 部分患者在使用他克莫司后会出现头痛症状，其发生概率约为10% - 30%。头痛程度因人而异，有的可能只是轻微的头部隐痛，有的则可能较为剧烈。震颤： 约有5% - 15%的患者会出现震颤情况，表现为手部、头部等部位不自主地颤抖，尤其是在肢体活动时可能会更加明显。
胃肠道方面的副作用
恶心呕吐： 大约20% - 40%的患者会出现恶心症状，其中部分患者可能会进一步发展为呕吐，一般在用药后的前几周内较为常见。腹泻： 有10% - 20%的患者会出现腹泻现象，腹泻程度轻重不一，轻者可能只是大便次数稍有增多，重者可能会频繁腹泻，影响患者的营养吸收和身体状况。
代谢方面的副作用
高血糖： 约有10% - 20%的患者在使用他克莫司后可能会出现血糖升高的情况，这是因为他克莫司可能会影响胰岛素的分泌或作用，需要密切监测血糖变化。高血脂： 大概5% - 15%的患者会出现血脂异常，表现为胆固醇、甘油三酯等指标升高，长期的高血脂可能会增加心血管疾病的风险。
肾脏方面的副作用
肾功能损害： 少数患者（约1% - 5%）在使用他克莫司过程中可能会出现肾功能损害，表现为血肌酐升高、肾小球滤过率下降等，需要定期监测肾功能指标，以便及时发现和处理可能出现的肾脏问题。