上气道咳嗽综合征的治疗药物需根据具体病因选择，常用的有抗组胺药物、鼻用糖皮质激素等。一般来说，抗组胺药物是治疗上气道咳嗽综合征的常用一线药物，比如第一代抗组胺药马来酸氯苯那敏，对缓解症状有一定作用，但可能会有嗜睡等不良反应；第二代抗组胺药如氯雷他定等，相对嗜睡副作用较轻，起效时间一般在用药后数小时到1天左右可见症状改善。
抗组胺药物的应用
第一代抗组胺药： 像马来酸氯苯那敏，它能竞争性阻断组胺H₁受体，从而减轻过敏引起的炎症反应等导致的上气道相关症状，但这类药物容易通过血脑屏障，可能会引起中枢神经系统抑制，出现嗜睡、困倦等表现，儿童使用时需谨慎，2岁以下儿童不建议随意使用。第二代抗组胺药： 例如氯雷他定，它对H₁受体的选择性更高，起效相对较快，嗜睡等中枢神经系统副作用较轻，一般每日服用1次即可，连续服用数天可见症状逐步缓解，对大多数上气道咳嗽综合征因过敏因素导致的情况有较好的疗效，成人和大于12岁的儿童可常规使用。
鼻用糖皮质激素的使用
作用机制： 鼻用糖皮质激素可以通过抑制炎症细胞的活化和炎症介质的释放，减轻鼻腔黏膜的炎症反应，减少分泌物的产生。比如糠酸莫米松鼻喷雾剂，它能有效减轻鼻黏膜的水肿、充血等情况，一般连续使用数天到1周左右，鼻腔相关症状会逐渐改善，进而缓解因鼻腔分泌物倒流刺激咽喉引起的咳嗽症状。注意事项： 儿童使用时需在医生指导下谨慎应用，要注意正确的使用方法，避免药物进入口腔过多引起全身不良反应。一般建议3岁以上儿童可在医生评估后使用，使用过程中要观察是否有鼻腔局部的刺激症状等。
白三烯受体拮抗剂的情况
药物举例： 孟鲁司特钠属于白三烯受体拮抗剂，它能特异性阻断白三烯受体，减轻气道炎症，对于上气道咳嗽综合征中可能存在的气道高反应等情况有一定的改善作用。成人及6岁以上儿童可使用，一般每晚服用1次，服用后可能在数天内逐渐看到咳嗽等症状的缓解，它的耐受性相对较好，不良反应较少见，主要有头痛等轻微不适，但一般不影响继续用药。上气道咳嗽综合征的具体用药还需医生根据患者的具体病情、年龄、过敏状态等综合因素来精准选择，患者不能自行随意用药，应在医生的指导下规范使用药物来控制症状。