小孩嗓子疱疹多由病毒感染引起，如柯萨奇病毒等。一般可根据具体症状选择药物，若有发热等症状可考虑使用对乙酰氨基酚等退热药物，若合并细菌感染可能需使用抗生素，但需医生判断后使用。
一、对症退热药物
如果小孩嗓子疱疹伴有发热，体温超过38.5℃且小孩有不适表现时，可考虑使用对乙酰氨基酚。不过要注意，需在医生指导下使用，且要根据小孩年龄和体重等情况谨慎选择，因为不同年龄段对药物的耐受等情况不同，低龄儿童使用需格外谨慎。
二、抗病毒药物
目前对于单纯疱疹病毒引起的嗓子疱疹，可在医生评估后考虑使用阿昔洛韦等抗病毒药物，但这类药物有一定的适应证和禁忌证，需严格遵医嘱，因为并非所有嗓子疱疹都需要使用抗病毒药物，要根据具体的病毒类型等情况判断。
三、局部缓解症状药物
可以使用一些局部喷雾或含片来缓解嗓子疼痛等症状，如含服西瓜霜含片等，但同样需要在医生指导下选择合适的药物，并且要考虑小孩的年龄，低龄儿童使用局部药物时要防止误吞等情况发生。同时，要让小孩多喝温水，保持口腔清洁，这对缓解嗓子疱疹引起的不适也有帮助，尤其是在饮食方面，要给小孩提供清淡、易吞咽的食物，避免刺激性食物加重嗓子的不适。