同房第六天肚子隐隐痛可能是怀孕、受精卵着床或其他原因引起的。
如果在排卵期同房，精子和卵子结合形成受精卵，大约在受精后6-7天受精卵会着床，部分女性可能会出现下腹隐痛、少许阴道流血等症状，这是正常的生理现象，一般不需要特殊处理。但这种腹痛通常比较轻微，不会很明显，而且持续时间也不会很长。
如果腹痛比较明显，或者伴有阴道出血量多、头晕、乏力等不适，需要警惕其他原因引起的腹痛，如盆腔炎、宫颈炎、异位妊娠等。此外，胃肠道疾病、腹部受凉等也可能导致肚子痛。
如果同房后第六天肚子隐痛持续不缓解，或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，如血HCG、B超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，仅凭肚子痛这一个症状很难明确原因，需要结合具体情况进行分析。如果有怀孕的计划，建议在同房后14天左右用早孕试纸或验孕棒检测晨尿，或直接去医院抽血检查HCG，以确定是否怀孕。如果没有怀孕的计划，建议在同房时采取有效的避孕措施，如戴避孕套、服用避孕药等，以免意外怀孕。同时，要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。