吃红心火龙果会拉肚子，主要是因为红心火龙果中含有一种称为甜菜红素的天然色素。人体难以完全吸收这种色素，未被吸收的部分就会随着肠道蠕动排出体外，从而导致大便变红，有时还可能引起轻微的肠道不适，大约有10% - 15%的人食用后会出现拉肚子的情况。
肠道敏感人群更易出现
肠道敏感者： 本身肠道比较敏感的人，食用红心火龙果后，甜菜红素对肠道的刺激相对更明显。比如一些患有肠易激综合征的人，肠道神经较为敏感，摄入红心火龙果后，肠道蠕动可能会加快，进而引发拉肚子。消化功能弱的人： 老人和小孩的消化功能相对较弱，对红心火龙果中成分的消化和吸收能力不如成年人。老人的胃肠蠕动功能减退，小孩的消化系统还未发育完善，所以他们食用红心火龙果后更易出现拉肚子的现象。
食用量过多导致
单次食用量较大： 如果一次食用较多的红心火龙果，比如超过200克，其中大量的甜菜红素和膳食纤维进入肠道，超过了肠道的承受和消化能力，就容易引起肠道蠕动紊乱，出现拉肚子。一般建议单次食用红心火龙果控制在100 - 150克比较合适。频繁大量食用： 有些人为了追求色彩或者其他原因，频繁大量食用红心火龙果，像一天吃两三个甚至更多，这样会使肠道持续受到较多甜菜红素的影响，肠道内环境被打破，从而导致拉肚子情况频发。
个体差异因素
基因因素： 不同人具有不同的基因，部分人的基因决定了他们对红心火龙果中甜菜红素的代谢能力较差。例如某些特定基因位点的人群，对甜菜红素的分解代谢速度慢，就更容易在食用红心火龙果后出现拉肚子且大便变红的情况。肠道菌群差异： 每个人的肠道菌群组成不一样，那些肠道菌群中能够分解甜菜红素的有益菌数量较少的人，食用红心火龙果后，甜菜红素不能被及时分解，就会通过肠道排出，引发拉肚子。比如肠道菌群失调的人，食用红心火龙果后更易出现这种状况。