男性上小便时尿道痛，可能由多种原因引起。比如尿道炎较为常见，大约有30% - 40%的非淋菌性尿道炎患者会出现尿道痛的症状。
尿道炎导致的尿道痛
淋菌性尿道炎：由淋病奈瑟菌感染引起，主要通过性接触传播，除了尿道痛，还可能有尿频、尿急，尿道口流脓等表现。非淋菌性尿道炎：多由沙眼衣原体或支原体感染所致，症状相对淋菌性尿道炎较轻，尿道会有瘙痒感，伴有不同程度的尿道痛。
泌尿系统结石引发的尿道痛
膀胱结石：除了尿道痛，还可能有排尿中断的情况，改变体位后又能继续排尿。尿道结石：会有排尿困难，点滴状排尿，而且疼痛会放射至阴茎头部。
前列腺炎造成的尿道痛
急性细菌性前列腺炎：起病急，除了尿道痛，还会有发热、寒战、尿频、尿急等全身及局部症状。慢性细菌性前列腺炎：症状相对缓和，有尿道不适或灼热感，排尿后和便后常有白色分泌物自尿道口流出。
外伤引起的尿道痛
外力撞击：比如会阴部受到外力撞击，会导致尿道局部损伤，出现尿道痛，同时可能有局部淤血、肿胀等表现。医源性损伤：如导尿等操作不当，可能损伤尿道黏膜，引起尿道痛。