咽喉炎的类型多样，治疗药物也因类型而异，并没有绝对最有效的单一药物。
病毒感染引发的咽喉炎
由病毒感染引起的咽喉炎，一般可使用抗病毒药物，如利巴韦林等，但多数情况下可通过自身免疫慢慢恢复，日常需注意休息、多饮水，保持室内空气流通。儿童感染病毒引发咽喉炎时，更要关注体温等情况，若有不适及时就医，且儿童用药需谨慎，优先考虑安全的非药物缓解方式。
细菌感染引发的咽喉炎
细菌感染导致的咽喉炎则需要使用抗生素，像青霉素类、头孢菌素类等抗生素可能会被选用。不过，使用抗生素要严格遵循医嘱，不能自行滥用。对于有基础病史的患者，使用抗生素时更要谨慎评估，避免出现不良反应。
过敏引发的咽喉炎
若是过敏因素引起的咽喉炎，需要使用抗过敏药物，如氯雷他定等。过敏体质的人群要尽量避免接触过敏原，在使用抗过敏药物时，要注意药物可能带来的嗜睡等副作用，尤其对于驾驶员等特殊职业人群需格外留意。
反流性咽喉炎
反流性咽喉炎则需要使用抑制胃酸的药物，例如质子泵抑制剂，像奥美拉唑等。有胃部基础病史的患者，在使用这类药物时要关注胃部的反应，同时要注意饮食，避免食用会加重反流的食物，如辛辣、油腻、过甜的食物等。