面肌痉挛的病因是由于面神经根部，即出脑干处受到异位扭曲的小血管压迫，造成神经纤维的脱髓鞘改变，继而造成神经传导的"短路"引起一侧面肌不自主的抽搐。
发病初期首选内科药物治疗，一般选用卡马西平。药物一般初期能有效控制发作，随着病情进展，药物作用可能越来越弱，剂量需要逐渐加大，最大可以每天服用12片。
当药物达到最大剂量后，仍然控制不住抽搐，或者出现药物副作用如头晕、嗜睡、粒细胞缺乏、肝功能损害等时，则需要手术治疗。
手术采取微创开颅微血管减压术，将压迫的血管和神经垫开。这种手术是针对面肌痉挛病因所治疗的，具有不破坏神经功能、效果良好、创伤小，已成为国内外公认的首选治疗面肌痉挛的外科手术方式。
但是毕竟为开颅手术，目前仍然存在一定的风险，如听力下降、脑出血等。对于年老体弱不能耐受开颅手术，或者拒绝开颅手术的，可采用肉毒素面部局部注射治疗，这种方法效果亦较好，但是容易复发，并且有面瘫、面部僵硬等并发症的发生。