口腔粘膜白斑与口腔扁平苔藓可从临床表现、好发部位、病理特点来区别。口腔粘膜白斑好发于40岁以上男性，病损为白色或灰白色斑块，边界清楚，可发生糜烂或溃疡；口腔扁平苔藓好发于中青年女性，病损为白色条纹状损害，可出现网状、树枝状、环状等，一般无糜烂。
临床表现区别
口腔粘膜白斑： 表现为口腔黏膜上出现白色或灰白色的斑块，质地较硬，有的斑块表面可有粗糙感，部分患者可能会有不适感或刺痛感。比如有的患者口腔内颊部出现大小不一的白色斑块，斑块边界清楚，用舌头舔时有粗糙的感觉。口腔扁平苔藓： 病损多为白色条纹状损害，可呈网状、树枝状、环状等，患者一般自觉有瘙痒感，有的患者在进食刺激性食物时会有轻微疼痛。例如患者口腔两颊黏膜可见白色网状的条纹，伴有轻度瘙痒。
好发部位区别
口腔粘膜白斑： 多见于颊黏膜、唇黏膜、舌黏膜等部位。其中颊黏膜是较为常见的发病部位，其次是唇黏膜，在舌背、牙龈等部位也可能发生。口腔扁平苔藓： 好发于颊黏膜，其次是舌、牙龈、前庭沟等部位。病变多左右对称分布，颊黏膜的病损常呈网状、树枝状等。
病理特点区别
口腔粘膜白斑： 组织病理表现为上皮增生，有过度正角化或过度不全角化，或两者同时出现为混合角化。棘层增厚，上皮钉突伸长且变粗，但基底膜清晰。有的白斑伴有不同程度的上皮异常增生。口腔扁平苔藓： 病理表现为上皮不全角化，棘层增厚较多，少数萎缩变薄，上皮钉突呈锯齿状，基底细胞液化变性，基底膜界限不清，黏膜固有层有淋巴细胞浸润带。