小儿斜视的原因有多种，其中先天性因素较为常见，约有15%左右的小儿斜视是由于先天发育异常导致的眼外肌附着点位置异常、肌肉本身发育异常等引起。
先天发育因素：
眼部肌肉发育异常： 胎儿在发育过程中，如果眼部肌肉发育出现异常，比如某条眼外肌过强或过弱，就可能影响眼球的正常运动平衡，从而引发斜视。一般在婴儿出生后不久就可能显现出斜视的迹象。遗传因素： 遗传也是小儿斜视的一个重要原因。如果家族中有斜视的遗传病史，孩子患斜视的概率会比正常家庭的孩子高。研究发现，约1/3的斜视患儿有家族斜视遗传史。
眼部疾病因素：
屈光不正： 当小儿存在高度远视、近视或散光等屈光不正问题时，会影响眼睛的正常聚焦功能。为了看清物体，眼睛会过度调节，长期如此可能导致眼位偏斜，引发斜视。例如，高度远视的小儿，由于看远看近都需要很强的调节力，更容易出现内斜视。眼部肿瘤： 眼部如果长有肿瘤，如视网膜母细胞瘤等，会影响眼球的正常结构和功能，导致眼球运动异常，进而引发斜视。这种情况相对较少见，但一旦发生需要及时治疗。
后天环境因素：
用眼习惯不良： 长时间看电视、玩电子设备等，会使小儿眼睛长时间处于紧张状态，容易导致眼肌疲劳，影响眼位的控制，增加斜视的发生风险。比如，每天连续看电视超过2小时的小儿，斜视的发生率比控制在1小时以内的小儿要高。头部外伤： 头部受到外伤后，可能会损伤眼部的神经或肌肉，从而引起斜视。如果小儿头部曾有过明显的撞击等外伤史，家长要密切观察孩子是否有斜视的表现。