三个月吃两次紧急避孕药可能会导致一些短期的副作用，但具体影响因人而异。以下是一些可能出现的情况：
1.月经紊乱：紧急避孕药可能会干扰月经周期，导致月经提前、推迟或经量增多、减少。这种情况通常会在几个月内自行恢复。
2.恶心、呕吐：部分人在服用紧急避孕药后可能会出现恶心、呕吐等胃肠道反应。
3.乳房胀痛：少数人可能会感到乳房胀痛。
4.头痛、疲劳：有些女性可能会经历头痛和疲劳感。
需要注意的是，紧急避孕药不能作为常规的避孕方法，因为它含有较高剂量的激素，频繁使用可能会对身体造成不良影响。以下是一些建议：
1.了解正确的避孕方法：选择适合自己的长期避孕方法，如避孕药、避孕套、宫内节育器等，并正确使用。
2.咨询医生：如果对避孕药的使用有任何疑虑或担忧，应咨询医生以获取个性化的建议。
3.关注身体变化：密切关注自己的身体状况，如果出现异常症状持续不缓解或加重，应及时就医。
4.健康生活方式：保持健康的生活方式，包括均衡饮食、适量运动和减少压力，有助于维持身体的健康。
总之，虽然紧急避孕药在某些情况下是有效的，但应谨慎使用，并遵循医生的建议。如果对避孕或健康问题有任何具体的担忧，最好咨询专业的医疗保健提供者。