原发性闭经且先天性子宫内膜薄会对女性生殖系统和身体健康产生一系列危害，具体包括以下几个方面：
1.生育能力下降：子宫内膜薄会影响受精卵的着床和发育，从而导致受孕困难或习惯性流产。
2.月经异常：原发性闭经患者通常会出现月经稀少、月经周期不规律等症状，这可能会影响女性的生育能力和生活质量。
3.心血管疾病风险增加：研究表明，子宫内膜薄与心血管疾病的发生风险增加有关。
4.情绪问题：长期的月经异常和生育问题可能会导致女性出现情绪问题，如焦虑、抑郁等。
对于原发性闭经且先天性子宫内膜薄的患者，应及时就医，进行全面的检查和评估。治疗方法包括激素替代治疗、宫腔粘连分离术等。此外，患者还应注意生活方式的调整，保持健康的饮食和适量的运动，以提高身体免疫力和生殖系统健康。
需要注意的是，每个人的身体状况和病情都不同，治疗方案应根据个体情况制定。在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗，定期进行复查，以确保治疗效果和身体健康。