HPV39高危型阳性通常不会自愈，建议及时就医，进行规范治疗。如果确实出现了HPV39高危型阳性自愈的情况，可能是以下原因：
1.自身免疫力较强：HPV感染是一种常见的性传播疾病，但大多数HPV感染是一过性的，可被人体自身免疫系统清除。如果患者自身免疫力较强，可能会在没有接受任何治疗的情况下自行清除HPV病毒，导致HPV转阴。
2.检查误差：HPV检测可能会出现假阳性或假阴性结果。如果患者在进行HPV检测前使用了某些药物、接受了某些治疗，或者存在其他疾病，都可能影响检测结果的准确性。因此，如果患者出现HPV高危型阳性自愈的情况，需要进行多次检测，以确保结果的准确性。
3.治疗方法有效：某些治疗方法可能有助于清除HPV病毒，如抗病毒药物、免疫调节剂、物理治疗等。如果患者在感染HPV后接受了有效的治疗，可能会促进HPV病毒的清除，导致HPV转阴。
需要注意的是，HPV感染是一种常见的性传播疾病，如果不及时治疗，可能会导致宫颈癌等严重后果。因此，如果患者出现HPV感染，应及时就医，进行规范治疗。同时，患者应注意个人卫生，避免不洁性行为，以预防HPV感染的发生。