脑干脑炎是发生于脑干的炎性脱髓鞘病变。临床上不多见，转化为多发性硬化的几率为30%之50%。多留有后遗症。
本病的特点多发于青壮年，常为急性或亚急性发病并进行性加重。
发病前约有半数有上呼吸道和肠道感染史，临床表现有一侧或两侧脑干受累的症状和体征。脑脊液改变较少，常有前驱感染史、急性或亚急性起病。
主要表现为多路神经损害，共济失调、意识障碍。
脑干脑炎病症的严重程度差别很大，轻度脑炎的症状跟任何病毒感染相同。头痛、头热、体力衰弱、没有食欲。
较严重的脑干脑炎症状，是脑的功能受到明显的影响，造成心烦气躁、不安及嗜睡。
最严重的症状是壁部和腿部肌肉无力、双重视觉、延及听觉困难。有些病例的嗜睡现象会转变为昏迷不醒等。