人流三天后肚子疼可能由多种原因引起。一般来说，可能与子宫收缩、宫腔残留、感染等因素有关。
子宫收缩引起的肚子疼
子宫复旧收缩：人流后子宫需要收缩恢复到孕前状态，这种收缩可能会引起肚子疼，一般疼痛程度较轻，呈间歇性，通常会持续数天。比如大部分女性在人流后1~2天内会有这种子宫收缩引起的轻微腹痛。宫缩强度影响：如果女性对子宫收缩比较敏感，可能感觉肚子疼相对明显些，但一般属于正常的生理恢复过程。
宫腔残留导致的肚子疼
残留组织刺激：如果人流后宫腔内有妊娠组织残留，残留的组织会刺激子宫收缩，从而引起肚子疼，这种疼痛往往比较剧烈，而且可能会伴有阴道流血量增多的情况。一般在人流后几天内就可能出现，而且腹痛持续不缓解。比如超声检查可能会发现宫腔内有不均质回声团块。残留大小差异：残留组织越少，肚子疼相对可能轻一些；残留组织越多，肚子疼越明显，甚至可能导致阴道大量出血等更严重情况。
感染引发的肚子疼
术后感染原因：人流后如果不注意个人卫生，或者过早同房等，容易引起宫腔感染。感染发生后，子宫会出现炎症反应，导致肚子疼。这种肚子疼往往伴有阴道分泌物异常，比如分泌物有异味、颜色发黄等，还可能伴有发热等症状。一般在人流后3~7天左右可能出现感染相关腹痛。感染程度不同表现：轻度感染时，肚子疼可能相对较轻，仅有下腹隐痛；重度感染时，肚子疼剧烈，还可能伴有寒战等全身症状。如果人流三天后肚子疼持续不缓解或者疼痛剧烈，伴有大量阴道出血、发热等异常情况，应及时就医，通过超声等检查明确原因，并采取相应的治疗措施。