妇科小肚子疼的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.排卵性腹痛：青春期女孩在排卵时，卵泡破裂，卵泡液对腹膜可能有一定的刺激作用，所以她们有时会出现左右交替的、每月一次的轻微腹痛。这属于生理性的，表现多为一侧性下腹隐痛、钝痛或坠胀样疼痛，部分少女同时伴有少许阴道出血，即排卵期出血，多在一两天后自行消失，一般不超过七天。这种腹痛多无任何病理改变，妇科检查也完全正常，属于生理性腹痛，一般不需处理。
2.痛经：痛经分原发性与继发性痛经两种。原发性痛经常见于青春期少女，原因与体内前列腺素水平、寒冷、情绪心理因素有关。而继发性痛经常见原因为子宫内膜异位症及子宫腺肌症。表现为疼痛逐渐加重，多呈周期性发作，或非经期下腹有隐痛而行经前后加重。此外，常伴有不孕及月经失调，往往需要药物治疗。
3.卵巢黄体破裂：这是因黄体内出血较多所致，伴有突然发作的下腹部或一侧的腹痛，严重时还可出现休克。卵巢黄体破裂绝大部分发生在月经周期的第20～26天，发病时可出现下腹部疼痛，轻重不一。卵巢黄体破裂的治疗方法因人而异。
4.与妊娠有关的疾病：近年来，少女妊娠的病例并不少见，而她们在此之前所遭遇的误诊也不少见。卵巢妊娠、输卵管间质部妊娠、子宫残角妊娠等，都属宫外孕，发生破裂时，可出现急性腹痛。宫外孕的症状多为停经后不久，出现下腹部一侧隐痛或阵发痉挛痛，为输卵管妊娠破坏时的主要症状，常伴有恶心呕吐。若血液局限于病变区，表现为下腹局部疼痛；当血液积聚在子宫直肠陷凹时，肛门有坠胀感；当出血量过多时，可引起晕厥。此外，宫外孕还会引起腹腔内出血、剧痛，甚至导致失血性休克。
5.与妇科炎症有关：多见于附件炎和盆腔炎，多发生于育龄妇女，疼痛在一侧或两侧，同时伴有白带增多。慢性者往往呈现出隐痛、腰酸痛或有坠胀感；急性者往往表现为腹痛拒按，并伴有发热。
6.急性阑尾炎：是一种少女常见的下腹部疼痛，其特点是始于上腹，后逐渐转移到右下腹，同时表现为恶心、呕吐、不想吃东西等。
7.其他：人工流产及安环发生子宫穿孔时，可出现急性下腹疼痛。卵巢宫内膜囊肿（巧克力囊肿），于月经期囊肿增长大可发生破裂，囊肿内容刺激腹膜而发生严重腹痛。
总之，引起妇科小肚子疼的原因较多，患者应及时就医，明确病因，对症治疗。