三个月宝宝拉肚子，可能由多种原因引起，治疗方法因病因而异。以下是一些建议：
1.观察宝宝的症状：如果宝宝拉肚子的同时，还伴有发热、呕吐、精神萎靡、尿量减少等症状，可能是感染引起的，需要及时就医。如果宝宝精神状态良好，食欲正常，可以先在家观察。
2.注意宝宝的饮食：如果是母乳喂养的宝宝，妈妈要注意自己的饮食，避免吃辛辣、油腻、生冷的食物。如果是人工喂养的宝宝，可以适当减少奶量，增加喂奶次数，或者将奶冲稀一些。
3.给宝宝补充水分：拉肚子会导致宝宝体内水分流失，要及时给宝宝补充水分，可以口服补液盐，也可以喂一些白开水。
4.注意宝宝的臀部护理：拉肚子会使宝宝的臀部发红、疼痛，要及时更换尿布，保持臀部清洁干燥，可以涂抹一些护臀膏。
5.不要自行用药：三个月的宝宝还小，身体各器官发育尚未完善，不要自行给宝宝使用药物，尤其是抗生素。如果需要用药，一定要在医生的指导下使用。
总之，三个月宝宝拉肚子，要密切观察宝宝的症状，如果症状持续不缓解或者加重，一定要及时就医。同时，要注意宝宝的饮食和臀部护理，给宝宝补充水分，避免宝宝脱水。