12岁孩子发烧39℃，可以先尝试物理降温，如减少衣物、温水擦拭等，同时多喝水，如果体温持续不降或孩子精神状态不好，应及时就医。以下是对发烧39℃原因及解决办法的具体分析：
1.感染：是引起孩子发烧最常见的原因，如病毒、细菌、支原体等感染。可以通过血常规、C反应蛋白等检查明确病因，在医生的指导下使用抗病毒或抗生素药物进行治疗。
2.免疫系统疾病：某些自身免疫性疾病也可能导致孩子发烧，如系统性红斑狼疮、幼年特发性关节炎等。需要进一步检查相关自身抗体、免疫球蛋白等指标，以明确诊断，并使用免疫抑制剂或激素等药物进行治疗。
3.恶性肿瘤：血液系统肿瘤、实体瘤等也可能引起孩子发烧。需要进行骨髓穿刺、影像学等检查，以明确肿瘤的部位和性质，进而制定相应的治疗方案。
4.其他：如中暑、药物热等也可能导致孩子发烧。
在治疗期间，孩子需要注意休息，保持营养均衡，可适当食用富含维生素的食物，如水果、蔬菜等，避免食用辛辣、油腻的食物。同时，应密切关注孩子的体温变化和精神状态，如有异常应及时就医。