儿童反复肺炎的原因有多种。据统计，约有20%左右的儿童反复肺炎与自身免疫功能异常有关。
一、解剖结构因素
气道狭窄： 儿童的气道相对较窄，尤其是3岁以下的幼儿，气道管径小，容易发生阻塞。例如，当呼吸道受到感染时，分泌物更容易堵塞气道，导致肺部通气不畅，引发反复肺炎。纤毛运动功能差： 儿童呼吸道的纤毛运动功能尚不完善，清除呼吸道分泌物的能力较弱。3岁以内儿童的纤毛摆动频率和力度都不如成人，使得痰液等分泌物难以有效排出，容易在肺部积聚，增加肺炎反复发生的风险。
二、基础疾病影响
先天性心脏病： 患有先天性心脏病的儿童，心脏结构和功能异常会影响肺部血液循环。比如室间隔缺损的患儿，左向右分流增加肺血流量，使肺部容易淤血，容易反复发生肺部感染，引发肺炎。据临床统计，约30%伴有先天性心脏病的儿童会出现反复肺炎的情况。免疫缺陷病： 先天性免疫缺陷病患儿的免疫系统存在缺陷，无法有效抵御病原体的入侵。常见的如体液免疫缺陷，体内抗体产生不足，不能及时清除肺炎病原体，导致肺炎反复发生。这类患儿反复肺炎的发生率明显高于正常儿童。
三、环境因素作用
空气污染： 长期处于空气污染严重的环境中，如雾霾天气较多的地区，空气中的有害颗粒和污染物会刺激儿童呼吸道，损伤呼吸道黏膜，降低呼吸道的防御功能。研究表明，在PM2.5浓度较高的环境中生活的儿童，反复肺炎的发生率比空气质量良好地区的儿童高约15%。被动吸烟： 儿童如果长期处于被动吸烟的环境中，烟草中的有害物质会损害呼吸道上皮细胞，抑制纤毛的运动，削弱呼吸道的自净能力。有数据显示，经常接触二手烟的儿童反复肺炎的发病几率是不接触二手烟儿童的2倍左右。