亚急性甲状腺炎总是反复可能是由于未针对病因治疗、治疗不彻底、患者自身免疫功能异常等原因所致，可以通过药物、手术等方式进行治疗，建议及时就医，在医生的指导下进行针对性治疗。具体分析如下：
1.未针对病因治疗：亚急性甲状腺炎是一种与病毒感染有关的自限性疾病，如治疗期间未针对病因治疗，仅使用非甾体类抗炎药或糖皮质激素缓解症状，停药后病情可能会再次复发。
2.治疗不彻底：亚急性甲状腺炎患者在症状缓解后，需要遵医嘱逐渐减量停药，若自行停药或减量过快，病情可能会再次复发。
3.患者自身免疫功能异常：亚急性甲状腺炎的发生与自身免疫功能异常有关，如患者自身免疫功能仍存在异常，可能会导致疾病再次复发。
患者在治疗期间需要注意休息，避免过度劳累，保证充足的睡眠。饮食上可适当增加热量、蛋白质及维生素的摄入，避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、生姜、生蒜等。同时，患者还需要定期复查甲状腺功能，以便及时调整治疗方案。