月经末期出现褐色分泌物，多是因为月经快结束时经血量减少，血液在生殖道内停留时间较长，氧化后颜色变深所致。一般来说，这种情况若持续不超过7天，且没有其他不适症状，可能是正常现象。
正常生理情况
子宫内膜修复阶段：月经末期，子宫内膜开始进行修复，此时脱落的子宫内膜较少，出血也相应减少，血液在宫腔或阴道内留存一段时间后排出，就会呈现褐色。比如正常月经周期28-30天，月经持续3-7天，末期出现褐色分泌物属于正常的内膜修复过程。激素水平波动：月经周期中激素水平有变化，末期雌激素水平略有波动，可能影响子宫内膜的剥落情况，导致少量出血氧化后呈褐色。
病理因素导致
妇科炎症
宫颈炎：宫颈部位有炎症时，宫颈黏膜充血、水肿，月经末期宫颈局部可能有少量出血，与白带混合后呈褐色。患者可能伴有白带增多、异味等症状。子宫内膜炎：子宫内膜发生炎症，月经末期子宫内膜修复不良，容易出现少量持续出血，表现为褐色分泌物。同时可能有下腹部坠胀、疼痛等症状。
内分泌失调
黄体功能不全：黄体分泌的孕激素不足，会导致子宫内膜分泌反应不良，月经末期可能出现少量持续出血，呈褐色。患者可能月经周期缩短等情况。甲状腺功能异常：甲状腺激素分泌异常会影响内分泌系统，进而影响月经，可能出现月经末期褐色分泌物。比如甲状腺功能减退时，身体代谢变慢，可能影响月经的正常排出。
其他情况
宫内节育器影响：放置宫内节育器后，部分女性可能出现月经末期褐色分泌物。这是因为节育器刺激子宫内膜，导致局部少量出血。一般适应3-6个月后可能会有所改善。妇科肿瘤：如子宫内膜息肉、子宫肌瘤等，也可能导致月经末期出现褐色分泌物。子宫内膜息肉会使子宫内膜面积增大，影响子宫收缩，导致经期延长或末期有褐色分泌物；子宫肌瘤尤其是黏膜下子宫肌瘤，会影响子宫收缩及内膜血运，引起月经异常，包括末期褐色分泌物。