孕晚期脖子上长小肉粒，可能是以下原因引起：
1.丝状疣：人乳头瘤病毒感染可导致丝状疣，常出现在颈部、额头、眼睑等部位。孕期由于激素水平变化，可能会导致丝状疣增多、增大。一般无明显不适，有时可能会伴有轻微瘙痒。可通过激光、冷冻等物理方法去除疣体。
2.皮赘：也叫软纤维瘤，是一种有蒂的良性肿瘤，常见于颈部、腋窝、腹股沟等部位。孕期皮赘可能会增多、增大。一般无明显不适，也不需要特殊治疗。如果觉得影响美观，可以通过激光、冷冻、电灼等方法去除。
3.湿疹：如果脖子上的小肉粒伴有瘙痒，可能是湿疹引起的。湿疹是一种过敏性皮肤病，可由多种内外因素引起，如遗传、环境、感染、饮食等。孕期湿疹可能会加重，需要注意皮肤清洁，避免搔抓，可外用炉甘石洗剂、氧化锌软膏等药物缓解症状。
4.其他：孕晚期脖子上长小肉粒还可能是其他原因引起的，如皮脂腺增生、传染性软疣等。
如果小肉粒持续不消失或逐渐增大，或伴有疼痛、瘙痒等不适，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持皮肤清洁，避免搔抓，避免感染。