儿童幽门螺杆菌感染后症状表现多样，部分儿童可能没有明显症状，而有症状的儿童可能会出现反复腹痛，疼痛部位不固定，多数为脐周附近疼痛，疼痛程度一般较轻；还可能伴有消化不良，表现为食欲减退、嗳气、反酸等，约有10% - 20%的感染儿童会出现这种情况；另外，少数儿童可能会出现贫血，表现为面色苍白、乏力等。
消化系统相关症状
腹痛表现： 儿童幽门螺杆菌感染引起的腹痛没有特定的规律，可能在进食后加重，也可能在空腹时出现。有些儿童腹痛症状较为轻微，容易被忽视，往往会被家长误以为是孩子调皮或者肠胃偶尔不适。消化不良体现： 食欲方面，感染幽门螺杆菌的儿童可能对食物缺乏兴趣，食量较平时减少。嗳气时能闻到酸臭味，这是因为胃部消化功能受到影响，食物在胃内停留时间较长，产生了气体。反酸则是胃酸反流至食管，刺激食管黏膜引起的不适感觉。
全身表现
贫血情况： 长期幽门螺杆菌感染可能会影响儿童的营养吸收，尤其是铁的吸收，从而导致缺铁性贫血。此时儿童除了面色苍白外，还可能会有精神萎靡的表现，在活动后容易出现气喘、乏力等症状，与正常活泼好动的儿童状态有明显区别。
其他可能症状
呕吐现象： 部分感染幽门螺杆菌的儿童会出现呕吐症状，呕吐物多为胃内容物，严重时可能会伴有胆汁。如果呕吐频繁，还可能导致儿童脱水，出现口渴、尿量减少等表现。生长发育受影响： 由于幽门螺杆菌感染影响营养吸收，对于处于生长发育关键阶段的儿童来说，可能会出现身高、体重增长缓慢的情况，对比同年龄、同性别儿童，身高体重不达标。