小孩尿道感染多是由细菌等病原体入侵引起的。据统计，女孩尿道感染的发生率比男孩高，这与女孩尿道短等生理结构有关。
生理结构因素
女孩尿道短： 女孩的尿道长度通常在3 - 5厘米左右，相对较短，而且尿道外口靠近肛门，肛门周围的细菌很容易污染尿道，从而引发感染。例如，当小孩不注意个人卫生，便后擦拭不当，细菌就容易从肛门附近蔓延到尿道。男孩包皮问题： 男孩如果存在包皮过长或包茎的情况，包皮内容易藏污纳垢，长时间不清洁，就可能滋生细菌，增加尿道感染的风险。比如，包皮内的包皮垢会为细菌提供良好的生存环境，细菌大量繁殖后可能侵入尿道引发感染。
卫生习惯因素
个人卫生不佳： 小孩如果没有养成良好的卫生习惯，像不经常清洗外阴，就容易让尿道受到细菌等病原体的侵袭。特别是在夏天，小孩出汗多，如果不及时清洁，细菌更容易滋生。例如，每天应该让小孩用清水清洗外阴，保持局部清洁干燥。尿布更换不及时： 对于还在使用尿布的婴幼儿，如果尿布长时间不更换，尿液和粪便会刺激尿道周围皮肤，并且为细菌繁殖创造条件，进而引发尿道感染。一般建议每隔2 - 3小时就更换一次尿布，保持臀部干爽。
机体免疫力因素
免疫力较低： 小孩的机体免疫力相对较弱，尤其是婴幼儿阶段。免疫系统还没有完全发育成熟，对病原体的抵御能力较差，更容易受到细菌等病原体的感染。比如，6个月到2岁的小孩免疫力处于相对较低的阶段，这个时期尿道感染的发生率相对较高。如果小孩患有某些基础疾病，如先天性尿路畸形等，也会影响机体的免疫力，使得尿道感染的几率增加。