一般来说，新生儿肛门闭锁产前诊断能检查出来。
肛门闭锁是一种比较常见的先天性消化道畸形，产前超声检查是发现胎儿肛门闭锁的重要方法。在怀孕20~24周时，通过系统胎儿超声检查，可发现大多数的胎儿肛门闭锁。
此外，磁共振成像（MRI）对诊断肛门闭锁也有一定的帮助，尤其对于一些复杂性的肛门闭锁，如合并直肠会阴瘘等。
需要注意的是，产前超声检查也有一定的局限性，可能会受到胎儿体位、羊水等因素的影响，导致部分肛门闭锁无法被发现。如果医生在产前检查中怀疑胎儿有肛门闭锁，可能会建议进一步进行产前咨询、染色体核型分析等检查，以明确诊断。
如果新生儿出生后被发现有肛门闭锁，应及时就医，医生会根据具体情况制定治疗方案。一般来说，新生儿肛门闭锁的治疗主要包括手术治疗和术后护理。手术治疗的目的是恢复肛门的正常解剖结构和功能，术后护理则需要注意保持肛门周围的清洁、预防感染等。
总之，产前诊断可以在一定程度上发现新生儿肛门闭锁，但也存在一定的局限性。如果对胎儿的健康有任何疑虑，建议及时与医生沟通，了解更多相关信息。