16岁月经两个月没来，可能与以下因素有关。
青春期激素水平不稳定：青春期时，女孩的卵巢功能尚未完全发育成熟，激素水平容易出现波动，从而导致月经不规律。这种情况通常会随着年龄的增长逐渐改善。
情绪因素：长期的紧张、焦虑、压力等情绪问题可能影响激素的正常分泌，导致月经推迟。
体重变化：过度节食或剧烈运动导致体重下降过快，可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，引起月经失调。
其他因素：生活环境的改变、长期熬夜、剧烈运动等也可能对月经产生影响。
需要注意的是，虽然大多数情况下，16岁女孩月经不规律是正常的生理现象，但也不能完全排除其他潜在的健康问题。以下情况需要及时就医。
有性生活：如果女孩有性生活，月经推迟需要首先排除怀孕的可能。
伴随其他症状：除了月经推迟，还伴有腹痛、乳房胀痛、体重增加或减少、多毛等症状，可能是其他疾病引起的，如多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等。
长期不规律：如果月经推迟持续时间较长（超过3个月）或不规律，也需要就医检查，以确定是否存在其他健康问题。
就医后，医生通常会进行详细的问诊和身体检查，可能会建议进行一些辅助检查，如激素六项检查、B超等，以了解卵巢和子宫的功能，确定具体的原因，并给予相应的治疗建议。
对于16岁的女孩，家长和社会应该给予更多的关注和支持，帮助她们了解月经的生理知识，缓解心理压力，保持良好的生活习惯。如果女孩对月经问题有疑问或担忧，家长应及时与医生沟通，以确保她们的健康和成长。