吃紧急避孕药可能会带来一些副作用。一般来说，服用紧急避孕药后约有10%的人可能会出现月经紊乱，比如月经提前或推迟。
胃肠道方面的副作用
恶心： 部分人服用紧急避孕药后会出现恶心的症状，大约有5% - 10%的人会比较明显，一般在服药后的几个小时内出现，程度轻重不一。呕吐： 少数人可能会发生呕吐，尤其是在服药后不久就发生了呕吐，这时候可能需要补服药物，因为药物可能还没有被完全吸收。
内分泌系统的影响
激素水平波动： 紧急避孕药含有较高剂量的孕激素，会影响体内的激素平衡。它可能会导致雌激素水平相对降低，从而影响正常的内分泌调节。比如，服药后可能会出现乳房胀痛的情况，大约有20%左右的人会有不同程度的乳房胀痛，一般持续几天会逐渐缓解。对下次月经的影响： 除了月经紊乱，还可能使下次月经的周期发生改变，有的女性下次月经会提前，有的会推迟，提前或推迟的时间可能在1 - 2周左右。
其他可能的副作用
头晕： 大约有5%的人服用紧急避孕药后会出现头晕的症状，一般程度较轻，休息后多可缓解。疲劳： 部分人会感觉身体比较疲劳，精神状态不如平时，这种疲劳感一般会持续1 - 2天。需要注意的是，紧急避孕药不能作为常规避孕方法，一个月经周期内一般只能用一次，一年中使用也不宜超过3次，频繁使用会增加上述副作用发生的概率，而且它的避孕有效率也低于常规避孕方法，所以建议选择更适合的常规避孕方式，如避孕套、短效避孕药等。