月经不来可能会带来多方面危害。一般来说，长期月经不来可能影响女性生殖健康等。比如，对于有性生活的女性，月经不来首先要排除怀孕可能，若不是怀孕，长期月经不来可能与内分泌失调等有关，长期内分泌紊乱可能增加患子宫内膜病变风险等。
对生殖系统的影响
子宫内膜异常增生风险： 正常月经周期中，子宫内膜会周期性脱落。如果月经不来，子宫内膜会持续受雌激素影响而无孕激素对抗，长期如此可能导致子宫内膜异常增生，甚至增加子宫内膜癌的发病几率。据相关研究，长期月经不来的女性患子宫内膜癌的风险比正常月经周期女性高出一定比例。卵巢功能受影响： 月经正常是卵巢功能正常的一个体现，月经不来往往提示卵巢功能可能出现问题，比如多囊卵巢综合征患者常伴有月经稀发或闭经情况，而多囊卵巢综合征会影响卵子的正常排出，进而影响生育能力，导致受孕困难。
对骨骼健康的影响
骨密度降低： 雌激素对维持骨骼健康很重要，月经不来会使雌激素水平下降，影响钙的吸收和利用，导致骨密度降低，增加骨质疏松的发生风险。尤其是绝经前女性月经不来，若持续时间较长，骨量丢失会加快，到中老年时更容易发生骨折等情况。
对心理健康的影响
情绪问题： 月经不来可能会给女性带来心理压力，引发焦虑、抑郁等情绪问题。比如一些年轻女性因月经长时间不来，担心自己身体出现严重问题，从而产生焦虑情绪，而长期的焦虑抑郁又可能进一步影响内分泌，形成恶性循环。据统计，有相当一部分月经不调（包括月经不来）的女性存在不同程度的心理情绪异常。