肾脏萎缩的治疗需根据具体病因等情况来定。一般来说，若是慢性肾炎导致的肾脏萎缩，可能需要长期控制血压、减少蛋白尿等，比如血压需控制在130/80mmHg以下等；如果是肾动脉狭窄引起的肾脏萎缩，可能需要考虑介入治疗等。
针对原发病治疗
病因明确型：如果是由肾动脉狭窄导致的肾脏萎缩，需要针对肾动脉狭窄进行处理。比如肾动脉狭窄较轻时，可考虑药物控制血压等情况；若狭窄严重，可能需要通过介入手术放置支架来扩张肾动脉，改善肾脏血供，有可能一定程度上阻止肾脏进一步萎缩，但很难完全恢复到正常大小。病因不明型：对于一些病因不太明确的肾脏萎缩情况，需要进一步检查明确可能的病因。比如进行肾活检等检查，若发现是免疫相关因素导致，可能会使用免疫抑制剂等药物来控制病情发展，延缓肾脏萎缩进程。
生活方式调整
饮食方面：要注意低盐饮食，每天盐的摄入量最好控制在3-5克以内。同时要优质低蛋白饮食，根据肾功能情况合理摄入蛋白质，一般每公斤体重每天摄入0.6-0.8克左右的优质蛋白，像鸡蛋、牛奶、瘦肉等是较好的优质蛋白来源。还要控制磷的摄入，避免食用过多高磷食物，如动物内脏、坚果等。水分摄入：根据尿量情况调整水分摄入，如果尿量正常，一般每天饮水量保持在1500-2000毫升左右；若尿量较少，需要严格控制饮水量，避免加重肾脏负担。
并发症防治
高血压防治：肾脏萎缩患者很多会伴有高血压，而高血压又会进一步加重肾脏损伤。所以要积极控制血压，除了前面提到的饮食等基础控制外，可能需要使用降压药物，如ACEI或ARB类药物，这类药物不仅能降压，还能减少蛋白尿，保护肾脏。贫血防治：肾脏萎缩患者常伴有肾性贫血，因为肾脏分泌促红细胞生成素减少。这时需要补充促红细胞生成素，同时补充铁剂等，纠正贫血情况，改善患者的一般状况。