同房时肚子疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.生理性因素：
动作过于剧烈：在同房过程中，如果动作过于剧烈或姿势不当，可能会导致腹部肌肉受到刺激或牵拉，从而引起肚子疼。
缺乏润滑：如果同房时缺乏足够的润滑，阴茎或其他器官在进入阴道时可能会摩擦阴道壁，引起疼痛。
2.妇科疾病：
盆腔炎：盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症，可导致同房时肚子疼。
子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位，可能会引起性交疼痛。
子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，较大的肌瘤可能会在同房时引起疼痛。
3.其他因素：
消化系统问题：如胃溃疡、胃炎等，也可能在同房时引起肚子疼。
心理因素：焦虑、紧张等心理因素可能会导致肌肉紧张，从而引起肚子疼。
如果同房时经常出现肚子疼，或肚子疼持续时间较长、程度较重，建议及时就医，进行详细的检查和诊断。医生可能会进行妇科检查、超声检查等，以确定具体的原因，并给予相应的治疗建议。
此外，对于一些特殊人群，如孕妇、哺乳期妇女、有妇科疾病史的人群等，在同房时需要特别注意，如有不适应及时就医。同时，保持良好的性生活卫生习惯，使用安全套等，也有助于预防一些妇科疾病的发生。
总之，同房时肚子疼可能是生理性的，也可能是病理性的，需要根据具体情况进行分析和处理。如果有任何疑虑或担忧，最好咨询医生的意见。