怀孕49天内可以药物流产，但必须在医生的指导下进行。
药流是通过药物而非手术终止早孕的一种避孕失败的补救措施。药流的适用时间在怀孕的早期（从末次月经的第一天算起的39～49天之中），药流避免了手术流产的疼痛及发生某些并发症，达到有孕止孕、无孕催经的目的。但药流也有一定的风险，如药流不全、出血时间长、感染等，还可能会影响以后的生育。
因此，在决定药流前，需要进行全面的身体检查和评估，包括B超检查、血常规、尿常规、白带常规、心电图等，以确保身体状况适合药流。同时，药流需要在正规的医疗机构进行，在医生的指导下服用药物，并注意观察出血情况和身体反应。如果药流过程中出现大出血、剧烈腹痛等异常情况，应及时就医。
此外，药流也有一些禁忌症，如：
米非司酮禁忌：肾上腺、糖尿病、甲状腺等内分泌疾病、妊娠期皮肤瘙痒病史、血液病史、与甾体激素有关的肿瘤、心血管疾病、血液凝固功能障碍、与甾体激素有关的恶性肿瘤、不顺应治疗、过敏体质、妊娠剧吐、长期服用抗癫痫药、抗抑郁药、巴比妥类药物等。
米索前列醇禁忌：心血管系统疾病、低血压、青光眼、胃肠功能紊乱、过敏体质、带宫内节育器妊娠者。
需要注意的是，药流并不是一种绝对安全的避孕方法，也可能会导致失败和并发症。因此，在日常生活中，应做好避孕措施，避免意外怀孕。如果已经怀孕，应及时就医，根据个人情况选择合适的终止妊娠方式。