乙肝表面抗原阴性一般意味着没有感染乙肝病毒。但也有一些特殊情况需要考虑。比如，在感染乙肝病毒的早期，可能还没产生足够量的表面抗原，这时候也可能出现表面抗原阴性的情况，但体内已经有病毒感染了。
检测误差情况
检测灵敏度问题： 乙肝表面抗原的检测有一定的灵敏度范围。如果检测方法的灵敏度不够高，可能会出现假阴性结果。一般来说，正规医院采用的检测方法灵敏度能达到较高水平，但不同的检测机构可能存在差异。比如一些基层医疗机构使用的检测设备相对老旧，可能在极个别情况下漏检。采样与运输因素： 采血过程中如果操作不当，比如采血不顺利导致血液稀释过度，或者血液样本在运输过程中保存不当，也可能影响检测结果，出现表面抗原阴性的假阴性情况。
既往感染恢复情况
感染后康复： 当人体曾经感染过乙肝病毒，但通过自身的免疫系统已经将病毒清除，并且产生了相应的抗体，这时候乙肝表面抗原就会呈阴性。这种情况下，体内可能存在乙肝表面抗体等保护性抗体，对乙肝病毒有抵抗力。一般来说，感染乙肝病毒康复后，表面抗原阴性且伴有抗体阳性是比较好的情况。
疫苗接种后的表现
疫苗接种产生效果： 接种乙肝疫苗后，人体会产生免疫反应，产生乙肝表面抗体。如果接种成功，乙肝表面抗原会呈阴性，同时乙肝表面抗体呈阳性。一般全程接种乙肝疫苗后，大约有90%以上的人会产生有效的抗体。接种乙肝疫苗需要按照0、1、6个月的程序进行接种，接种后需要检测抗体情况来确认是否接种成功。