有了胎心胎芽仍有可能发生胎停，临床数据显示，约有5% - 10%的孕妇在出现胎心胎芽后会发生胎停。
胚胎自身因素导致胎停
染色体异常：即使已经出现胎心胎芽，胚胎自身染色体如果存在数目或结构的异常，仍可能引发胎停。比如常见的三体综合征等染色体数目异常情况，会影响胚胎的正常发育进程，进而导致胎停发生。基因缺陷：胚胎基因存在缺陷时，也无法正常完成后续的生长发育过程，即便前期有胎心胎芽出现，后续也可能出现胎停情况。
母体因素引发胎停
内分泌失调：孕妇体内的激素水平对胚胎发育至关重要。例如甲状腺功能异常，无论是甲状腺功能亢进还是减退，都会影响胚胎的发育环境。若甲状腺激素分泌不足或过多，都可能干扰胚胎的正常生长，增加胎停的风险。像甲状腺功能减退的孕妇，体内甲状腺激素水平偏低，会影响胚胎的代谢等一系列过程，容易导致胎停。自身免疫性疾病：患有系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病的孕妇，自身免疫系统会错误地攻击胚胎组织，破坏胚胎的生长环境，使得有胎心胎芽的胚胎也可能发生胎停。
外界不良因素影响
环境因素：长期处于含有有害物质的环境中，比如接触过多的放射性物质、化学毒物等。孕妇长时间接触高浓度的甲醛、苯等化学物质，会对胚胎的发育产生不良影响，增加胎停的几率。生活方式不当：孕妇过度吸烟、酗酒，烟草中的尼古丁和酒精都会对胚胎造成毒害。研究表明，孕妇每天吸烟超过10支，胎停的风险会明显升高；长期大量饮酒的孕妇，胚胎发生胎停的可能性也大大增加。