一、正常生理现象
1.神经系统发育不完善：婴儿的神经系统尚在发育中，大脑对身体肌肉的控制还不够协调。在浅睡眠阶段，可能会出现摇头晃脑的情况，这是神经系统发育过程中的正常表现，随着月龄增长会逐渐改善。一般来说，3-6个月的婴儿较为常见这种情况，因为此阶段神经系统发育处于快速但不完善的时期。
2.温度调节：小孩新陈代谢旺盛，头部容易出汗，当汗液刺激头皮时，会让小孩感觉不适，通过摇头晃脑来摩擦头部以缓解瘙痒。比如环境温度过高或者穿着盖被过厚时，小孩头部出汗增多，就容易出现这种情况。不同年龄段的小孩对温度的感知和调节能力不同，婴儿皮下脂肪薄，体温调节能力相对较弱，更易受环境温度影响出现头部不适而摇头。
二、病理因素
1.湿疹：如果小孩头部、面部等部位长有湿疹，会伴有瘙痒感。小孩就会通过摇头晃脑来蹭痒。湿疹好发于婴儿时期，与婴儿的皮肤屏障功能尚未发育完全、过敏等因素有关。例如对某些衣物材质、洗护用品过敏时，湿疹发生概率增加，进而导致小孩因头部湿疹瘙痒而摇头晃脑。
2.耳部问题
-外耳道湿疹或感染：外耳道出现湿疹或者感染时，小孩会感觉耳部不适，可能会通过摇头晃脑来牵扯耳部，从而出现相应动作。婴儿时期外耳道较窄，容易发生炎症，若不注意耳部清洁等，就易引发外耳道问题。
-中耳炎：中耳炎也会导致小孩耳部疼痛、不适等，小孩可能会通过摇头晃脑来缓解耳部的异常感觉。上呼吸道感染等可能引发中耳炎，小孩年龄小，咽鼓管短而宽，平置，更易使病菌侵入中耳引发炎症。
3.维生素D缺乏性佝偻病：维生素D缺乏会影响钙的吸收，使神经兴奋性增高，小孩会出现多汗、摇头、烦躁不安等表现。多见于6个月以内尤其是3个月以内的婴儿，因为这个阶段婴儿生长发育快，若维生素D补充不足就易发生该病。
4.头部皮肤不适：头部有皮疹、头癣等情况时，会引起局部不适，导致小孩摇头晃脑。头癣是由真菌感染引起，在卫生条件差等情况下易发生，会让小孩头部皮肤瘙痒等而出现相应动作。
如果小孩频繁摇头晃脑且伴有其他异常表现，如发热、精神萎靡、生长发育迟缓等，应及时就医，进行详细检查以明确原因并采取相应措施。同时，家长要注意保持小孩头部清洁干燥，营造适宜的睡眠环境，合理喂养保证营养均衡，尤其是保证维生素D的合理摄入等，以促进小孩健康成长。