发烧眼睛疼时首先要关注体温情况，若体温超过38.5℃，可先考虑通过物理降温结合药物来缓解。比如用湿毛巾擦拭额头、腋窝等部位进行物理降温，同时可在医生指导下使用对乙酰氨基酚等退热药物来降低体温，体温下降后眼睛疼的症状可能会有所减轻。
物理降温方法
用湿毛巾敷眼： 准备干净的湿毛巾，拧干后敷在眼睛上，每次敷15~20分钟，能帮助缓解眼睛的不适。不过要注意毛巾的清洁，避免细菌感染。降低环境温度： 可以通过开空调等方式将室内温度调节到26℃左右，适宜的环境温度能让身体感觉舒适，也有助于减轻眼睛疼的症状。
针对病因治疗
感染性因素： 如果是感冒发烧引起的眼睛疼，多是病毒感染导致。这时除了退热，还可以使用抗病毒的眼药水，像阿昔洛韦眼药水等，但使用前需咨询医生。要是细菌感染引发的发烧伴眼睛疼，可能需要使用抗生素类眼药水，如氧氟沙星眼药水。非感染性因素： 如自身免疫性疾病导致的发烧眼睛疼，就需要针对具体的自身免疫病进行治疗，可能需要使用免疫抑制剂等药物，但必须在医生的专业诊断后规范用药。
休息与饮食注意
保证充足休息： 发烧时身体比较虚弱，要保证每天有7~8小时的睡眠时间，让身体得到充分休息，这样有利于身体恢复，眼睛疼的情况也会慢慢改善。合理饮食： 发烧眼睛疼时要多吃清淡易消化的食物，如小米粥、蔬菜汤等。同时要多喝水，每天至少喝1500~2000毫升水，补充身体因发烧流失的水分，也有助于身体新陈代谢，缓解不适。